L'essai est prévu pour une durée déterminée à l'avance, et au cours d'une visite de fin d'essai, la personne participant à l'étude est informée de l'arrêt du traitement tel qu'il était défini dans le protocole. Il faut le plus souvent plusieurs semaines ou plusieurs mois de plus (par rapport à cette visite de fin d'essai) pour que chaque personne ayant participé à l'étude, atteigne la durée de traitement prévue par le protocole. Ce n'est qu'une fois que la dernière personne entrée dans l'essai a achevé sa période de traitement que les données peuvent être analysées.

L'analyse finale de l'essai est de type statistique. Elle porte sur toutes les données recueillies au cours de la phase d'investigation. Elle a pour but de déterminer, selon des calculs statistiques précis, si les résultats obtenus avec le produit testé sont liés au hasard ou au produit lui-même.
En général, les résultats de l'analyse seront publiés ultérieurement dans une revue médicale référencée au niveau international.

Saisie des données
Les données recueillies lors d'un essai thérapeutique dans les cahiers d'observation sont enregistrées dans un programme informatique
On parle de double saisie lorsque les mêmes données sont "saisies" par deux personnes indépendamment l'une de l'autre. La double saisie permet, en comparant les deux saisies, de détecter les éventuelles erreurs survenues au cours de la saisie des données.